Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms