Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms