Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PI4K2AQ9BTU6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms