Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NXNL1Q96CM4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms