Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL2Q92772 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms