Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms