Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms