Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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