Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms