Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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RTN1Q16799 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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RTN1Q16799 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTN1Q16799 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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