Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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