Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms