Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CHD4Q14839 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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