Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD4Q12950 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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