Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms