Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms