Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
OC90Q02509 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms