Protein–RNA interactions for Protein: P86790

CCZ1B, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1BP86790 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCZ1BP86790 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms