Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms