Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
UBE2L3P68036 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2L3P68036 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms