Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms