Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms