Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL1P40616 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms