Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA10P31260 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms