Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPINB3P29508 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPINB3P29508 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms