Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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