Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGF3P11487 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGF3P11487 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGF3P11487 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms