Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms