Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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