Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms