Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA4BQ9NPR2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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