Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms