Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms