Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms