Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STAMBPL1Q96FJ0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms