Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINGO1Q96FE5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms