Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOT2Q8IXI1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms