Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms