Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms