Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F4Q16254 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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