Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms