Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP13Q15645 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms