Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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