Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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