Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms