Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms