Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 606.3 ms