Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ARL3P36405 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL3P36405 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms