Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRB3P28472 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms