Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BGNP21810 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BGNP21810 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BGNP21810 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms